肽的溶解性
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以我們的經(jīng)驗,溶解肽是一個很重要的環(huán)節(jié)。如果溶解不當(dāng)可能導(dǎo)致肽損失或者實驗失敗。肽的溶解性主要取決于肽的序列,所以,如果實驗允許,肽序列中至少應(yīng)包含20%的帶電殘基以增加其溶解度。
在使用之前,客戶可以遵循以下三個基本原則來選擇合適的溶劑溶解多肽。首先,所選溶劑一定能充分溶解多肽;其次,所選溶劑能與實驗條件兼容;*后,所選溶劑不能與肽反應(yīng),也不能使肽降解。只要肽的量允許,可以先用少部分肽溶解,然后再將全部樣品溶解。如果需要從溶劑中回收肽,可以選擇 一種初始溶劑使其在凍干后容易去除。
以下建議或許對您溶解肽有所幫助:
1. 少于5個氨基酸的肽一般溶于水溶液,強疏水的氨基酸(W,I,L,F,M,V,Y)除外。
2. 如果帶電氨基酸平均分布于全部序列中,那么含有>25%帶電氨基酸(E,D,K,R,H)的親水肽和含有<25%疏水氨基酸的肽一般都能溶于水溶液。多肽的純化系統(tǒng)一般為0.1%TFA/水和0.1%TFA/ ACN。因此,如果肽溶解在沒有緩沖能力或者緩沖能力很弱的緩沖液中,結(jié)果可能導(dǎo)致肽溶液呈酸性。在使用別的方法溶解肽時務(wù)必使溶劑的pH值近乎中性。酸性肽(E+D殘基數(shù)多于K+R+H殘基 數(shù))和堿性肽(K+R+H殘基數(shù)多于E+D殘基數(shù))在中性pH值條件下比在酸性pH值下更易于溶解。
3. 對于疏水氨基酸含量為50%~75%的肽,即使序列中含有>25%帶電氨基酸也有可能不溶于水或者部分溶解。*好先把肽溶于*少量的強有機溶劑如DMF、ACN、異丙醇、乙醇、乙酸、4-8M GdnHCl、 尿素,或者DMSO(序列中沒有C,W,M時),及其它類似的有機溶劑中。*好將溶解肽的有機溶 劑緩慢地逐滴加入水溶液中,如果溶液變渾濁,可能是達(dá)到了溶解極限,繼續(xù)溶解就沒什么用了。 需要注意的是,*開始選擇的溶劑應(yīng)該與實驗系統(tǒng)兼容。
4. 疏水氨基酸含量>75%的強疏水肽一般也不溶于水溶液。此類肽也應(yīng)該先用強有機溶劑(如TFA,甲酸)溶解,如果將其加入到水溶液中也可能產(chǎn)生沉淀。*后的肽溶液可能需要高濃度的有機溶劑使之變性,而有機溶劑一般不用于活細(xì)胞的生物功能研究。
5. S,T,E,D,K,R,H,N,Q,Y含量高(>75%)的多肽序列容易形成多余的分子間氫鍵網(wǎng)絡(luò), 在濃的水溶液中容易形成凝膠。此類肽可以用步驟3所述方法溶解。為了減少溶解中可能出現(xiàn)的問題,建議客戶從設(shè)計上和序列上多加考慮,以改善肽的溶解度。