多肽合成:二硫鍵形成
二硫鍵是很多蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)中不可或缺的組成部分。我們幾乎可以在所有的胞外肽類和蛋白質(zhì)分子中發(fā)現(xiàn)這些共價鍵。當(dāng)一個半胱氨酸的硫原子與位于蛋白質(zhì)不同位置的另一半胱氨酸的硫原子形成共價單鍵時,一個二硫鍵就形成了。這些鍵有助于穩(wěn)定蛋白質(zhì),特別是那些從細胞中分泌的蛋白質(zhì)。
一個二硫鍵的有效形成涉及多方面,包括對半胱氨酸的恰當(dāng)管理、對該氨基酸殘基的保護、保護基團的脫除方法和配對方法等。
如果多肽中只含有1對Cys,那二硫鍵的形成是簡單的。多肽經(jīng)固相或液相合成,然后在pH8-9的溶液中進行氧化。
當(dāng)需要形成2對或2對以上的二硫鍵時,合成過程則相對復(fù)雜。盡管二硫鍵的形成通常是在合成方案的 后階段完成,但有時引入預(yù)先形成的二硫化物是有利于連合或延長肽鏈的。使用 廣泛的Cys的保護基團有Bzl、Meb、Mob、tBu、Trt、Tmob、TMTr、 Acm、Npys等。
S-acetomidomethyl(Acm)在酸和堿中都非常穩(wěn)定,因此,Acm與Boc和Fmoc化學(xué)成份都是兼容的。一些保守的半胱氨酸殘基對蛋白-蛋白結(jié)合和蛋白-蛋白相互作用至關(guān)重要。部份研究利用Ala替換Cys來破壞二硫鍵結(jié)構(gòu)。另外還可以利用Acm修飾Cys,這種修飾會阻止二硫鍵的形成,同時還保持蛋白中Cys的結(jié)構(gòu)。
S- Acm經(jīng)溶液如醋酸汞((Hg[OAc]2)在pH 4.0的緩沖液中處理1h后可被去除,從而可獲得自由巰基?;虮籗-Acm-阻斷的多肽可以在苯甲醚存在下,以TFA作為溶劑,經(jīng)三氟甲烷磺酸銀在0℃處理1h。而在固相合成過程中,當(dāng)多肽仍然錨定在支撐物上時,經(jīng)Hg(OAc)2 (0.06M)在DMF中于20℃避光條件反應(yīng)3小時即可,隨后用DMF和DMF-β-巰基乙醇(9:1,v/v)洗滌,將Hg2 +從被解塊的肽-樹脂中去除。
為什么半胱氨基(Cys)如此特殊?
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Cys的側(cè)鏈有一個非?;钴S的反應(yīng)性巰基。此基團中的的氫原子可很容易地被自由基和其他基團取代,因而易與其他分子形成共價鍵。
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二硫鍵是許多蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)中的重要組成部分。二硫橋鍵可降低肽的彈性、增加剛度,并減少潛在構(gòu)象的數(shù)量。這樣的構(gòu)象限制對生物活性和結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性來說是至關(guān)重要的。它的替換對蛋白質(zhì)的整體結(jié)構(gòu)來說將可能是戲劇性的。
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疏水性氨基酸如Leu、Ile、Val是螺旋的穩(wěn)定劑。因為即使半胱氨酸沒有形成二硫鍵也可以使α螺旋穩(wěn)定。即如果所有的半胱氨酸殘基處于還原態(tài)(-SH,攜帶自由巰基),高百分比的螺旋片段將有可能。
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半胱氨酸形成的二硫鍵對三級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定來說是持久的。在大多數(shù)情況下,鍵間的S-S橋?qū)π纬伤募壗Y(jié)構(gòu)是必須的。有時形成二硫鍵的半胱氨酸殘基在 結(jié)構(gòu)中相距甚遠。
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二硫鍵的拓撲是分析蛋白質(zhì) 結(jié)構(gòu)同源性的基礎(chǔ)。位于同源蛋白的半胱氨酸殘基是非常保守的。僅色氨酸在統(tǒng)計學(xué)上比半胱氨酸更為保守。
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半胱氨酸位于巰基酶催化部位的中心。半胱氨酸可直接與底物形成?;虚g體。還原形態(tài)作為“巰基緩沖器”維持著蛋白中的半胱氨酸處于還原態(tài)。在低的pH值時,平衡偏向還原態(tài),-SH形式,而在堿性環(huán)境下,-SH更傾向于被氧化,形成-SR,而 R是除氫原子外的任何物質(zhì)。
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? 半胱氨酸也可作為解毒性與過氧化氫和有機過氧化物反應(yīng)。
多重二硫鍵形成方案